1. Per què
1.1. S'escriu separat quan introdueix frases interrogatives, tant si són directes (amb signes d'interrogació) com indirectes (sense signes). Equival a per quin motiu.
Per què no has vingut? (interrogativa directa)
Vull saber per què no has vingut (interrogativa indirecta)
1.2. També s'escriu separat quan fa de pronom relatiu.
Aquests són els motius per què no he vingut
(= Aquests són els motius pels quals no he vingut)
2. Perquè
2.1. S'escriu junt quan és conjunció. Pot tenir valor causal i valor final.
No he vingut perquè no m'he trobat bé (causal)
Els van convocar a la reunió perquè hi exposessin el seu punt de vista (final)
2.2. També s'escriu junt quan és substantiu (va precedit d'article).
El perquè de tot plegat
Els perquès del seu comportament
3. En tots els casos s'escriu amb accent.